5 konečných vědeckých distribucí Linuxu

5 konečných vědeckých distribucí Linuxu

Čas na pop kvíz: jaké jsou vědecké distribuce Linuxu?





Odpověď je celkem zřejmá: zatímco většina distribucí Linuxu je obecného účelu, některé specializované jsou dodávány s určitým typem softwaru. Existují například distribuce mediálních center, ty, které z vašeho počítače udělají multimediální produkční studio, a dokonce i několik náboženských distribucí. Když to víte, nemělo by vás překvapit, že existují vědecká distribuce Linuxu. Konec konců, historie Linuxu začala ve výzkumných laboratořích a dnes Linux napájí servery a pracovní stanice největších světových výzkumných organizací.





Jednoduše řečeno, vědecké distribuce nabízejí předinstalovaný software pro různé účely výzkumu. Samozřejmě můžete své běžné Ubuntu transformovat na vědecké distro instalací stejných aplikací, ale smyslem takových distribucí je vyhnout se hledání jednotlivých aplikací. Místo toho poskytují rychlý způsob nasazení Linuxu ve výzkumných zařízeních, vzdělávacích institucích a na osobních počítačích studentů a uživatelů zajímajících se o vědu. Pokud jste mezi posledně jmenovanými, zde je pět skvělých vědeckých distribucí, které je třeba zvážit.





1. Bio-Linux

Toto zeleně zbarvené distro je zaměřeno na vědce, kteří pracují v bioinformatice-interdisciplinárním oboru, který kombinuje molekulární biologii a genetiku se statistikami a analytickými metodami z počítačové vědy. Bio-Linux byl vyvinut ve Středisku pro syntézu životního prostředí ve Velké Británii a je podporován a financován Centrem pro ekologii a hydrologii (CEH) a Radou pro výzkum přírodního prostředí (NERC).

Je to distribuce založená na Ubuntu, která je k dispozici pouze pro 64bitové systémy a nabízí dvě desktopová prostředí: Unity jako výchozí a MATE jako odlehčenou alternativu. Nejnovější verze (8.0.5) zaručuje díky jádru Ubuntu 14.04 dlouhodobou podporu. Bio-Linux 8 obsahuje doslova stovky nástrojů bioinformatiky, a to jak příkazového řádku, tak grafických. Abychom vám pomohli začít, nabízí Bio-Linux průvodce PDF .



Hlavní vlastnosti softwaru: Artemis, prohlížeč sekvencí DNA a aplikace pro poznámky; Galaxy, biomedicínská výzkumná platforma založená na prohlížeči; Fasta, pro vyhledávání databází DNA a proteinů; Mesquite, pro evoluční biologii; njplot, pro kreslení fylogenetických stromů, a Rasmol, pro vizualizaci makromolekul. Pokud chcete do svého systému založeného na Ubuntu nainstalovat balíčky z Bio-Linuxu, můžete jednoduše přidat jejich úložiště .

Bio-Linux je k dispozici zdarma jako živý obraz a jako soubor OVA v případě, že jej chcete spustit ve VirtualBoxu.





Alternativní: BioSLAX, vědecká distribuce založená na Slackware zaměřená na bioinformatiku a vyvinutá na Národní univerzitě v Singapuru.

2. Poseidon Linux

Stejně jako Bio-Linux má Poseidon Linux také barevné schéma: jemné modré tóny, které odpovídají jeho mořskému názvu. Branding byl inspirován oceánology, kteří na projektu pracují, ale Poseidon Linux není jen pro jedno odvětví vědy. Místo toho nabízí širokou škálu nástrojů, od 2D a 3D vizualizace, genetiky a programovacích aplikací až po podporu statistik, numerického modelování a mapování.





Poseidon Linux je výsledkem transatlantické spolupráce mezi Federální univerzitou Rio Grande v Brazílii a institutem MARUM v Německu. Aktuální stabilní verze (4.0) zaostává za dobou, protože je založena na Ubuntu 10.04. Poseidon 5.0 je však ve vývoji a slibuje dlouhodobou podporu (spoléhá na Ubuntu 12.04) a Unity jako výchozí desktopové prostředí-vítaný upgrade ze starého GNOME 2.30, který je dodáván s Poseidon 4.0.

Hlavní vlastnosti softwaru: Lab Plot, pro interaktivní grafy a analýzu dat; QCAD, pro 2D kreslení; Blender pro 3D modelování a QGIS, kompletní geografický informační systém.

jak obnovit iphone v režimu obnovení

Můžeš stáhnout Poseidon Linux zdarma v 32- i 64bitových edicích.

Alternativní: Pokud potřebujete pouze geografické a mapovací nástroje, zkuste to OSGeo , produkt Lubuntu od Open Source Geospatial Foundation.

3. CAElinux [již není k dispozici]

Klíč je v názvu: CAE je zkratka pro Computer-Aided Engineering a toto vědecké distro je ideální pro každého, kdo pracuje s CAD, modelováním, prototypováním, 3D tiskem a fyzikálními simulacemi. CAElinux, vyvinutý ve Švýcarsku, je založen na Xubuntu 12.04 a vyžaduje 64bitový systém. Kromě Xfce nenabízí žádné desktopové varianty, ale výběr softwaru je působivý.

Hlavní vlastnosti softwaru: Salome, pro 3D CAD a síťování; GMSH, pro modelování geometrie; Scilab, pro matematické programování; Paraview, pro 3D vizualizaci; ImageJ, pro zpracování a analýzu obrazu, a Elmer, pro složité fyzické modely.

CAElinux je k dispozici jako živý obraz DVD zdarma, nebo si můžete objednat fyzickou kopii za dostupnou cenu.

Alternativní: Pokud nepotřebujete veškerý pokročilý inženýrský software a chcete jen nástroje pro 3D modelování a animaci, vyzkoušejte ArtistX, kterému jsme se podrobně věnovali.

jak vytvořit obrázek s průhledným pozadím

Čtyři. Vědecký Linux

Po všech těchto distribucích založených na *buntu je Scientific Linux opravdovým kombinátorem: je to přestavba Red Hat Enterprise Linux. Nejnovější verze (7.1, s kódovým označením Nitrogen) vyšla nedávno, ve třech variantách-KDE, GNOME a IceWM-pouze pro 64bitové systémy. Jeho základna však není to jediné, čím Scientific Linux vyniká. Na rozdíl od jiných distribucí, které jsou plné vědeckého softwaru, Scientific Linux nabízí pouze základní sadu aplikací. Jaké záludné, zavádějící distro!

No ne tak úplně. Scientific Linux je ve skutečnosti vyvinut vědci z Fermi National Accelerator Laboratory a Evropské organizace pro jaderný výzkum (CERN). I když ve výchozím nastavení nenabízí mnoho vědeckých aplikací, v úložištích jsou snadno dostupné desítky. S kodeky a podporou bezdrátového připojení je Scientific Linux skvělou volbou pro vědecké prostředí, ve kterém se očekává, že vše bude fungovat bez přílišného vrtání. Uživatelé si mohou nainstalovat pouze software, který potřebují, takže jejich systém nebude přeplněn aplikacemi, které nikdy ani neotevřou.

Hlavní vlastnosti softwaru: PostgreSQL a MySQL, pro databáze a vývoj aplikací; Textový editor GNU Emacs; R programovací jazyk; Frysk pro analýzu a monitorování systému a gnuplot pro vykreslování matematických výrazů. (Některé z těchto aplikací nebudou ve výchozím nastavení nainstalovány, ale můžete je získat z úložišť.)

Scientific Linux lze stáhnout jako soubor Živý obraz DVD .

Alternativní: Vývojáři Scientific Linux podporují vytváření „roztočení“ nebo sestavení na základě jejich projektu. Jedno takové distro je Fermi Linux ; dobrá volba zaměřená na zabezpečení pro ty, kteří chtějí spustit Scientific Linux na 32bitovém systému.

5. Fedora Scientific

Tento spin Fedory představuje střední cestu mezi vysoce specializovanou a běžnou distribucí Linuxu. Jako takový je skvělý pro výzkumníky a studenty všech vědeckých oborů, i když se mírně přiklání k numerickému výzkumu. Výchozí desktopové prostředí je KDE a Fedora Scientific je k dispozici pro 32bitové i 64bitové architektury. Je vyvinut společností Amit Saha s podporou Fedora Science and Technology SIG. Krásná online dokumentace vám představí Fedora Scientific a provede vás výběrem softwaru.

Hlavní vlastnosti softwaru: Maxima, kompletní sada algebry; LaTeX, pro vytváření dokumentů a prezentací; Mayavi pro 3D vizualizaci dat a trifecta pro správu verzí: git, Mercurial a Subversion.

DVD Fedora Scientific Live si můžete stáhnout buď přímým stažením, nebo jako torrent.

Alternativní: Pokud hledáte uživatelsky přívětivou vědeckou distribuci zaměřenou na matematiku, Mathbuntu je dobrou náhradou za Fedora Scientific. Je k dispozici jako samostatná distribuce nebo jako sada balíčků pro vaši aktuální instalaci Ubuntu.

Bez ohledu na to, který vědecký obor vás zajímá, měli byste si z tohoto seznamu vybrat vhodnou distribuci. Nyní zpět k tomu pop kvízu - jaká je vaše oblíbená vědecká distribuce Linuxu? Můžete uvést další podobné distribuce, které by si zasloužily místo v tomto seznamu? Udělejte si domácí úkol a podělte se o svá doporučení v komentářích.

Kredity obrázku: Doporučený obrázek , Nagioská monitorovací stěna v NOC přes Flickr podle Docklandsboy , Snímek obrazovky Poseidon , Snímek obrazovky CAElinux, Vědecký Linux prostřednictvím Wikimedia Commons , Snímek obrazovky Fedora Scientific.

Podíl Podíl tweet E-mailem Průvodce pro začátečníky k animované řeči

Animační řeč může být výzva. Pokud jste připraveni začít s přidáváním dialogu do svého projektu, proces za vás rozdělíme.

Číst dále
Související témata
  • Linux
  • Linux Distro
O autorovi Ivana Isadora Devcic(24 článků zveřejněno)

Ivana Isadora je nezávislá spisovatelka a překladatelka, milovnice Linuxu a fanynka KDE. Podporuje a propaguje bezplatný i open source software a vždy hledá nové, inovativní aplikace. Zjistěte, jak se dostat do kontaktu tady .

Více od Ivany Isadory Devcic

Přihlaste se k odběru našeho zpravodaje

Připojte se k našemu zpravodaji a získejte technické tipy, recenze, bezplatné elektronické knihy a exkluzivní nabídky!

Kliknutím sem se přihlásíte k odběru